13所大学分两期进驻广州大学城，第一期进驻的大学有10所，分别是：中山大学大学城校区、华南理工大学大学城校区、华南师范大学大学城校区、广州大学大学城校区、广东外语外贸大学大学城校区、广州中医药大学、广东药学院大学城校区、广东工业大学、广州美术学院大学城校区、星海音乐学院。第二期进驻的大学有3所，分别是：南方医科大学、暨南大学和广州医科大学。