论文指导记录的填写方法如下：

首先需要做一个表格，内容都需要填写在表格中；记录老师在授课时分析论文应该注意的事项，讲述相关论文的格式和一些有代表性的论题以及阅读资料的重要性；选题，题目的确定意味论文大致内容的确定，所以选题需慎重；选题后查阅论文的相关资料以及书写时注意论文的书写格式。