民航局直属高校共有4所，分别为中国民航大学、中国民用航空飞行学院、上海民航职业技术学院、广州民航职业技术学院。
| 序号 | 学校名称 | 主管部门 | 所在地 | 层次 | 备注 |
| 1 | 中国民航大学 | 交通运输部（中国民用航空局） | 天津 | 本科 | 公办 |
| 2 | 中国民用航空飞行学院 | 交通运输部（中国民用航空局） | 四川德阳 | 本科 | 公办 |
| 3 | 上海民航职业技术学院 | 交通运输部（中国民用航空局） | 上海 | 专科 | 公办 |
| 4 | 广州民航职业技术学院 | 交通运输部（中国民用航空局） | 广东广州 | 专科 | 公办 |
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