1、第二部疾风传初始时，已是三年之后，大蛇丸身体一天比一天虚弱，本想此时占有佐助身体的他，却因佐助先对自己下了手而没能得逞，反被佐助的写轮眼封印在佐助自己的身体里。
2、在佐助与鼬对决时因佐助的查克拉耗尽，企图重新占有佐助时，却被鼬用万花筒写轮眼最后的术——须佐之男封印于十拳剑中。
3、一代枭雄就此落下帷幕。
4、(但据漫画393,大蛇丸也可能没有被完全封印.被封印的时候，掉落了一条白蛇，但被天照烧到，生死未卜，不知岸本写这些有何意图！） 不过，大蛇丸在第二部中看似被宇智波鼬封印，实则可能是躲起来等待机会夺取佐助的身体。
5、被佐助所攻击时显现本体为一条白蛇，兜把他的细胞寄生在自己身上(为了变强)，而兜的半张脸也变成了大蛇丸的半张脸。
6、而且现在几乎已经完全占领了兜的身体。
7、不过，从现在的剧情发展以及兜的表现来看，大蛇丸从兜身上复出的希望不大了。
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