1、外观不同。香菇的个头比较小，菌盖上裂纹比较浅显，以深色为主。花菇的个头比较大，菌盖呈裂纹状，白色和褐色相间，因此得名花菇。
2、生长环境不同。香菇多生长在潮湿温暖的地方，在我国南部地区分布较广。花菇只有在温差骤变的气候才会生长，在寒冷时且突然回暖的环境中产出来的质量更好。
3、价格不同。花菇对环境要求比较高，产量比较少，因此价格也更高。
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